La prueba de ADN en heces es un método relativamente nuevo para la detección de cáncer del colon. En lugar de buscar sangre en las heces (GFOBT o PIT), estas pruebas buscan mutaciones en el ADN de ciertas enfermedades causadas por tumores cancerosos o pólipos precancerosos. Las células de las lesiones precancerosas y cancerosas con estas mutaciones son eliminadas a menudo en las heces. Esta prueba puede ser capaz de detectar esas células y por lo tanto indica la presencia de pólipos precancerosos o cáncer del colon.

Debido a que mutaciones en el ADN pueden diferir entre los cánceres del colon, las pruebas de ADN en heces suelen centrarse en los marcadores múltiples para lograr altas tasas de detección. Además, debido a los marcadores de ADN pueden estar presentes en pequeñas cantidades sólo en las heces y se requieren métodos de laboratorio muy sensibles. Las nuevas pruebas de las heces de ADN demuestran las altas tasas de detección de cáncer del colon en etapa temprana. A diferencia de otras pruebas no invasivas, las nuevas pruebas de ADN de heces también pueden detectar pólipos precancerosos.